本刊作为学术性、综合性、全国性的《中国水产科学》，目前已成为我国水产界的重要学术期刊。在促进我国的水产科学研究，加强国际间学术交流、展示我院直属科研所、高校及地方科研院所的科研成果、进展等方面已发挥了重要的作用。本刊1998年获得全国优秀水产报刊评比一等奖，1999年被4家权威机构联合组成的中国科学文献计量评价中心定为二级数据库来源期刊，一级全文收录期刊及万方数据——数字化期刊群全文收录期刊。于2004年被评为“中国百种杰出学术期刊”。国外方面，被美国《海洋文摘》、《化学文摘》和《动物学记录》、英国《生物文摘》以及俄罗斯《科学文摘》收录。