复杂DNA甲基化指纹的制备方法

摘要：

本发明涉及一种用于组织和细胞型的表征、分类和鉴别，对组织和细胞群行为的预测，并用于对具有改变表达的基因的鉴定的方法。该方法，其特征在于：在从任何组织样品中获取的基因组DNA中，碱基胞嘧啶（而不是5－甲基胞嘧啶）经亚硫酸氢盐溶液处理转化为尿嘧啶。利用极短的或简并寡核苷酸扩增这样处理的基因组DNA的部分。$通过杂交或聚合酶反应检测扩增片段的剩余胞嘧啶。该分析所产生的、可自动适用于处理算法的数据的量可用于得出关于所分析细胞物质的表型的结论。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN98812738.5

申请日期：1998-11-27

公开/公告号：CN1283235

公开/公告日：2001-02-07

主分类号：C12Q1/68

申请/专利权人:EPI基因组有限公司

发明/设计人:A·欧莱克;S·S·欧莱克;J·沃尔特

主申请人地址:德国柏林

专利代理机构:中国国际贸易促进委员会专利商标事务所

代理人:樊卫民

国别省市代码:德国;DE

权利要求：

权利要求书1．组织和细胞型的表征、分类和鉴别方法，用于对组织和细胞群行为的预测，并用于对具有改变表达的基因的鉴定，其特征在于：在基因组DNA中，它从任一组织样品中获得，未受处理、受剪切或通过限制性内切核酸酶切割，将碱基胞嘧啶而不是5-甲基胞嘧啶经亚硫酸氢盐溶液处理以本来已知的方式转化为尿嘧啶，利用极短寡核苷酸或简并寡核苷酸或互补于连接体寡核苷酸的寡核苷酸，扩增这样处理的基因组DNA的部分，这些连接体寡核苷酸在亚硫酸氢盐处理之前已与切割的DNA的末端连接，总体上，富含鸟嘌呤DNA链上剩余胞嘧啶和／或得自扩增部分的富含胞嘧啶DNA链上的鸟嘌呤的量通过杂交或聚合酶反应检测，该量应使得该分析所产生的、可自动适用于处理算法的数据，有可能得出关于所分析细胞物质的表型的结论。