一种外源基因在大肠杆菌中相对翻译起始率的判定方法

摘要：

一种外源基因在大肠杆菌中相对翻译率的判定方法是通过对影响ｍＲＮＡ翻译起始速率的因素：翻译起始区二级结构的能量及核糖体、甲酰甲硫氨酰ｔＲＮＡ与ｍＲＮＡ翻译起始区结合的核糖体结合百分率，翻译起始延迟率和翻译起始区有效浓度进行定量分析计算，综合考虑这三者计算值与翻译起始率的关系，提出相对翻译起始率的公式和方法。藉此可判定蛋白质的翻译速率，可按此方法设计或改进ｍＲＮＡ翻译起始区，以提高外源基因在大肠杆菌系统中的表达量。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN97106347.8

申请日期：1997-04-02

公开/公告号：CN1167151

公开/公告日：1997-12-10

主分类号：C12N15/70

申请/专利权人:中国科学院上海生物化学研究所

发明/设计人:陆长德; 陈农安; 王易伦

主申请人地址:200031上海市岳阳路320号

专利代理机构:上海华东专利事务所

代理人:衷诚宣

国别省市代码:上海;31

权利要求：

一种外源基因在大肠杆菌中相对翻译起始率的判定方法，它是通过对大肠杆菌ｍＲＮＡ翻译起始区二级结构的能量及核糖体、甲酰甲硫氨酰ｔＲＮＡ与ｍＲＮＡ翻译起始区相互作用的能量进行定量分析来判定ｍＲＮＡ翻译起始区结构对于外源基因蛋白翻译起始率影响的方法，其特征在于该判定方法是通过对下面影响翻译起始率的三个主要因素：（１）ｍＲＮＡ翻译起始区的二级结构能量以及核糖体、甲酰甲硫氨酰ｔＲＮＡ与ｍＲＮＡ翻译起始区作用的能量及由这些能量决定的核糖体结合百分率，（２）ｍＲＮＡ翻译起始延迟率，（３）ｍＲＮＡ翻译起始区有效浓度，进行定量分析计算，并以上述三个计算值与翻译起始率之间的关系提出ｍＲＮＡ相对翻译起始率的计算公式为：Ｒｔｉ＝Ｐ↓［总］×ｔ／ｕ／Ｄ↓［总］。