SNP分子标记及其在青稞抽穗期性状辅助育种上的应用

摘要：

本发明公开了一个SNP分子标记及其在青稞抽穗期性状辅助育种上的应用，所述SNP分子标记位于SEQ ID No.1所示核苷酸序列的第101位，该位点具有T/C多态性，当该位点基因型为TT时，具有较长的抽穗期。本发明的SNP分子标记与青稞抽穗期紧密关联，通过对该位点进行基因分型，即可判断青稞种质的抽穗期长短，该SNP分子标记可用于青稞抽穗期性状的分子辅助育种。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN202311613671.0

申请日期：2023-11-29

公开/公告号：CN117385091A

公开/公告日：2024-01-12

主分类号：C12Q1/6895(2018.01)

申请/专利权人:青海大学

发明/设计人:李新;姚有华;姚晓华;吴昆仑

主申请人地址:810016 青海省西宁市宁大路253号

专利代理机构:成都方圆聿联专利代理事务所(普通合伙)

代理人:邓永红

国别省市代码:青海;63

权利要求：

1.与青稞抽穗期性状相关SNP分子标记，所述SNP分子标记位于SEQ ID No.1所示核苷酸序列的第101位，该位点具有T/C多态性，当该位点基因型为TT时，具有较长的抽穗期。 2.权利要求1所述的SNP分子标记在青稞抽穗期性状分子辅助育种上的应用。 3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述分子辅助育种的方法为：提取待鉴定青稞基因组DNA，以基因组DNA为模板，设计基于所述SNP分子标记的KASP正向引物F1、F2和通用反向引物R一起进行PCR扩增，利用荧光探针实现SNP分型，当该位点基因型为TT时，具有相对较长的抽穗期。 4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述KASP正向引物F1的核苷酸序列如SEQID No.2所示，KASP正向引物F2的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示，通用反向引物R的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示。 5.检测权利要求1所述SNP分子标记基因型的物质在青稞抽穗期性状分子辅助育种上的应用。 6.用于检测与青稞抽穗期性状相关SNP分子标记的KASP引物，其特征在于，所述KASP引物由正向引物F1、F2和通用反向引物R构成，正向引物F1的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示，正向引物F2的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示，通用反向引物R的核苷酸序列如SEQ IDNo.4所示。 7.权利要求6所述的KASP引物在检测权利要求1所述的SNP分子标记上的应用。