PRKN作为预测肿瘤对化疗敏感性的标志物的应用
本发明公开了PRKN作为预测肿瘤对化疗敏感性的标志物的应用。本发明通过整合分析公共数据库数据和实验发现：PRKN在肿瘤中缺失或低表达提示肿瘤对抗微管类化疗药物响应低，建议患者接受DNA损伤类化疗药物治疗；而肿瘤中PRKN基因的拷贝数扩增或PRKN的蛋白表达增加，则预测肿瘤对抗微管类化疗方案敏感，建议患者以接受含抗微管类化疗药物的化疗方案。因此，检测PRKN在肿瘤组织中的基因变异和表达水平，可以作为肿瘤患者化疗方案选择的标志物，为临床合理选择化疗方案提供指导。
发明专利
CN202210960260.8
2022-08-11
CN117587122A
2024-02-23
C12Q1/6886(2018.01)
中山大学孙逸仙纪念医院
尹东;陈恒星;李贇
510120 广东省广州市越秀区沿江西路107号
广州市华学知识产权代理有限公司
刘瑜
广东;44
1.检测肿瘤中PRKN基因变异和/或PRKN蛋白表达水平的试剂在制备用于预测肿瘤患者对化疗药物的敏感性和/或反应性的产品中的应用。 2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述的PRKN蛋白序列如SEQ ID NO.1所示。 3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述的化疗药物为DNA损伤类化疗药物和/或抗微管类化疗药物。 4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于： 所述的DNA损伤类化疗药物包括阿霉素、甲氨蝶呤、氟尿嘧啶、吉西他滨、阿糖胞苷、依托泊苷、环磷酰胺、顺铂和奥沙利铂，以及以上药物的衍生物中的至少一种； 所述的抗微管类化疗药物包括多西他赛、多西紫杉醇、紫杉醇、长春瑞滨和长春新碱，以及以上药物的衍生物中的至少一种。 5.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述的肿瘤为恶性肿瘤。 6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于：所述的肿瘤为乳腺癌。 7.根据权利要求1所述的应用，其特征在于： 所述的PRKN基因变异包括PRKN基因点突变、PRKN基因拷贝数增加和PRKN基因拷贝数缺失；其中，当检测到PRKN基因拷贝数缺失时，则预测该肿瘤对抗微管类化疗药物响应低或无响应，化疗时肿瘤患者应接受DNA损伤类化疗药物治疗；当检测到PRKN基因拷贝数增加时，则预测该肿瘤对抗微管类化疗药物敏感，化疗时肿瘤患者应接受含抗微管类化疗药物的化疗方案； 所述的检测PRKN蛋白表达水平为采用免疫组织化学方法，检测肿瘤组织中PRKN蛋白染色阳性的肿瘤细胞占肿瘤细胞总数的百分比；其中，若TPS小于或等于50％，则预测该肿瘤对抗微管类化疗药物响应低或无响应，化疗时肿瘤患者应接受DNA损伤类化疗药物治疗；若TPS大于50％，则预测肿瘤对抗微管类化疗药物敏感，化疗时肿瘤患者应接受含抗微管类化疗药物的化疗方案。 8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于： 所述的PRKN基因拷贝数增加为PRKN拷贝数大于2； 所述的PRKN基因拷贝数缺失为PRKN拷贝数小于2。 9.根据权利要求1所述的应用，其特征在于： 所述的检测肿瘤中PRKN基因变异的方法为基因组杂交芯片和/或全外显子测序； 所述的检测肿瘤中PRKN基因变异的取样样本为手术切除的肿瘤、穿刺活检取样的肿瘤，和/或血液循环肿瘤DNA样本； 所述的检测PRKN蛋白表达水平的方法为免疫组织化学染色； 所述的检测PRKN蛋白表达水平的取样样本为手术切除的肿瘤和/或穿刺活检取样的肿瘤等。 10.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述产品包括试剂盒、芯片、试纸和高通量测序平台。