CYP基因单核苷酸多态性的荧光原位杂交测序检测方法

摘要：

本发明公开了一种CYP基因单核苷酸多态性的荧光原位杂交测序检测方法，所述方法包括提取待测样本的DNA，并以DNA为模板进行单链化衍生，然后同时加入不同荧光标记的第一测序探针和第二测序探针与单链化衍生物进行杂交，最后对杂交结果进行判读。所述方法精准性高，稳定性好，快速，安全，易自动化操作，可在一个单链化衍生和杂交反应循环中完成对单核苷酸多态性的精准分型，从而了解受试者的基因型，能够为预防因危险因素引起的疾病及临床个体化用药提供指导。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN201811227193.9

申请日期：2018-10-22

公开/公告号：CN109182485A

公开/公告日：2019-01-11

主分类号：C12Q1/6874(2018.01)I

申请/专利权人:北京华夏时代生物工程有限公司

发明/设计人:王鹤尧;孙美娜

主申请人地址:102629 北京市大兴区中关村科技园区大兴生物医药产业基地天贵街3号院6号楼3层

专利代理机构:北京市众天律师事务所 11478

代理人:李新军

国别省市代码:北京;11

权利要求：

1.一种CYP基因单核苷酸多态性的荧光原位杂交测序检测方法，包括如下步骤：(1)提取待测样本的DNA；(2)以步骤(1)获取的DNA为模板，在dNTP、反应缓冲液、DNA切割剂存在的情况下，在寡核苷酸分子的引导下进行单链化衍生，所述寡核苷酸分子分为第一引导序列和第二引导序列，同时加入两条序列各异的测序探针，分别被定义为第一测序探针和第二测序探针，在所述两条探针的5’端分别被标记了彼此不同的荧光分子，在其3’端分别被标记了淬灭基团，所述第一引导序列、第二引导序列、第一测序探针和第二测序探针选自下列组合：SEQ ID NO：1、2、19和20；或者SEQ ID NO：3、4、21和22；或者SEQ ID NO：5、6、23和24；或者SEQ ID NO：7、8、25和26；或者SEQ ID NO：9、10、27和28；或者SEQ ID NO：11、12、29和30；或者SEQ ID NO：13、14、31和32；或者SEQ ID NO：15、16、33和34；或者SEQ ID NO：17、18、35和36；(3)对步骤(2)的单链化衍生物分别与第一测序探针和第二测序探针的杂交结果进行判读。