EGFR基因E19del突变数字PCR检测体系的优化方法及检测产品

摘要：

本发明涉及一种EGFR基因E19del突变数字PCR检测体系的优化方法，检测体系包括上游引物、下游引物、探针A、探针B、野生型模板和突变型模板；野生型模板是酶切后的正常人体gDNA，突变型模板是酶切后的插入EGFR基因E19del突变片段的突变质粒；将突变型模板和野生型模板按一定的拷贝数比例配制成标准品，采用数字PCR以中突变频率标准品为模板进行反应，根据反应数据制作数据统计图，选定野生型的荧光区域和突变型的荧光区域。采用数字PCR以野生型模板为模板进行反应，确定背景阈值。通过本发明的EGFR基因E19del突变数字PCR检测体系的优化方法优化后的检测产品准确度更高。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN201811190350.3

申请日期：2018-10-12

公开/公告号：CN109295223A

公开/公告日：2019-02-01

主分类号：C12Q1/6886(2018.01)I

申请/专利权人:上海赛安生物医药科技股份有限公司

发明/设计人:赵新泰;王明;潘文健

主申请人地址:200436 上海市宝山区上大路1号文景楼2楼

专利代理机构:上海海颂知识产权代理事务所(普通合伙) 31258

代理人:任益

国别省市代码:上海;31

权利要求：

1.一种EGFR基因E19del突变数字PCR检测体系的优化方法，其特征在于：所述检测体系包括上游引物、下游引物、探针A、探针B、野生型模板和突变型模板；所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示，所述探针A的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示，所述探针B的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示；所述野生型模板是酶切后的正常人体gDNA，所述突变型模板是酶切后的插入EGFR基因E19del突变片段的突变质粒；将突变型模板和野生型模板按1:100至1:900的拷贝数比例配制成中突变频率标准品，采用数字PCR以中突变频率标准品为模板进行反应，根据反应数据制作数据统计图，选定野生型的荧光区域和突变型的荧光区域，突变型的荧光区域与野生型的荧光区域中荧光信号拷贝数的比值与标准品理论的突变型模板和野生型模板的拷贝数比例相同；采用数字PCR以野生型模板为模板进行反应，突变型的荧光区域中出现的荧光信号拷贝数即为该检测体系的背景阈值。