ALS相关SOD1基因突变的检测方法及其引物组
本发明涉及分子生物学基因技术领域和医学领域,具体公开了一种用于肌萎缩侧索硬化症(ALS)相关SOD1基因突变的检测方法及其引物组。本发明对ALS相关SOD1基因突变区域序列进行分析,设计相应的引物,对样本基因组DNA特定区域序列经过多重PCR扩增,最后以Ion Torrent半导体芯片测序技术进行检测。本发明的检测方法具有通量大,特异性及灵敏度高,结果稳定,重复性好,检测速度快等优点。为肌萎缩侧索硬化症的遗传学方面的检测、测试、分析和评估提供了一条快速、可靠、准确的新途径,从而为该类疾病的临床诊断提供理论基础。
发明专利
CN201711493145.X
2017-12-30
CN109988827A
2019-07-09
C12Q1/6883(2018.01)
上海联吉医学检验所有限公司
裘敏燕
200331 上海市普陀区真北路3199弄1号210室
1.一种ALS相关SOD1基因突变的检测方法及其引物组,具体步骤为: 利用生物信息学知识和相关生物信息学软件,对公开数据库中所能检索到的ALS相关SOD1基因突变区域序列,用Primer Express Software 5.0软件设计PCR引物; 采用多重PCR的方法对待检测样本进行PCR扩增; 将PCR扩增产物进行扩增子文库的构建,ISP(Ion Sphere™ Particles, Ion微球)模板的制备,在Ion Torrent PGM系统上进行测序,并用软件对相关测序序列进行分析。 2.如权利要求1所述的一种ALS相关SOD1基因突变的检测方法及其引物组,其特征在于,所述的PCR引物组包括针对5个SOD1基因序列片段的引物,其序列分别为:SEQ ID No:1-SEQ ID No: 10: 5’- agtagaattaggaaccaggacctcggc -3’SEQ ID No: 1; 5’- cctcgcaaacaagcctcc -3’ SEQ ID No: 2; 5’- agtagaattactccaacttcgcacttttctta -3’ SEQ ID No: 3; 5’- cagcacagcacaacaccca -3’ SEQ ID No: 4; 5’- agtagaattagggagttttagcagtgtttctttt -3’ SEQ ID No: 5; 5’- gctatcgccattattacaagagtta -3’ SEQ ID No: 6; 5’- agtagaattagccctaatccatctgatgctt -3’ SEQ ID No: 7; 5’- ttatgcttatccttttatgaaaacttac -3’ SEQ ID No: 8; 5’- agtagaattaaagagtgactgcggaactaagg -3’ SEQ ID No: 9; 5’- gggctcagactacatccaagg -3’ SEQ ID No:10。 3.用于如权利要求1所述一种检测ALS相关SOD1基因突变的方法及其引物组,其特征在于,所述的引物组组成一种检测ALS相关SOD1基因突变的试剂盒。