一种从胸水中提取cfDNA的方法、试剂盒以及构建的cfDNA文库

摘要：

本发明涉及一种从胸水样本中提取cfDNA，用于构建高通量测序文库的方法，属于基因检测技术领域。本发明首次成功地从胸水中提取到了cfDNA，经验证可作为高通量测序文库构建的样本来源，并且可以成为血浆cfDNA 的一种有效补充；此外，该方法中通过对胸水样本中cfDNA大小片段分离后，使得胸水样本中的cfDNA纯度更高，使其更适合于DNA文库的构建，更利于后期突变的检出，可以解决常规仅通过血浆提取cfDNA建库的样本单一性和检出率问题。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN201710117869.8

申请日期：2017-03-01

公开/公告号：CN106867996A

公开/公告日：2017-06-20

主分类号：C12N15/10(2006.01)I

申请/专利权人:南京世和基因生物技术有限公司

发明/设计人:邵阳;汪笑男;吴雪;王富锋;包华;刘一川

主申请人地址:210061 江苏省南京市高新开发区新锦湖路3-1号中丹生态生命科学产业园02栋18楼

专利代理机构:南京正联知识产权代理有限公司 32243

代理人:邓唯

国别省市代码:江苏;32

权利要求：

一种从胸水中提取cfDNA的方法，其特征在于，包括如下步骤：第1步，对胸水样本进行离心分离；第2步，在第1步得到的上清中加入Carrier RNA、蛋白酶K、裂解液，进行孵育处理，再加入DNA析出液；第3步，将第2步得到的样品采用柱吸附的方式对cfDNA进行吸附，再经过解吸之后，获取到cfDNA。