一种PCR-DGGE\TGGE\SSCP引物筛选方法

摘要：

本发明公开了一种PCR-DGGE\TGGE\SSCP引物的筛选方法，从所研究的微生物生态体系的菌群序列特性出发进行PCR-DGGE\TGGE\SSCP引物筛选，筛选指标包括引物对的匹配情况及其扩增片段的区分度、平均差异度、平均长度和平均GC含量，最适的引物对是通过综合比较各引物对之间指标的优劣来确定的。本发明选取的引物具有很强的针对性同时无需进行繁琐的多引物筛选或联用的实验操作工作，有助于采用PCR-DGGE\TGGE\SSCP技术对所研究微生态体系的菌群多样性进行快速而准确的解析。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN201310372313.5

申请日期：2013-08-24

公开/公告号：CN103436615A

公开/公告日：2013-12-11

主分类号：C12Q1/68(2006.01)I

申请/专利权人:福州大学

发明/设计人:倪莉;黄志清;陈芳;黄山;靳爽

主申请人地址:350108 福建省福州市闽侯县上街镇大学城学园路2号福州大学新区

专利代理机构:福州元创专利商标代理有限公司 35100

代理人:蔡学俊

国别省市代码:福建;35

权利要求：

一种PCR‑DGGE\TGGE\SSCP引物筛选方法，其特征在于：从微生物生态体系的菌群序列特性出发进行PCR‑DGGE\TGGE\SSCP引物筛选，筛选指标包括引物匹配情况及其扩增片段的区分度、平均差异度、平均长度和平均GC含量。