一种借助RT-LAMP检测人感染H7N9亚型禽流感病毒的引物及应用
本发明涉及一种检测病毒的引物及应用,尤其是一种检测禽流感病毒的引物及应用,属于医学技术领域。本发明利用RT-LAMP技术,运用生物信息学知识和相关的生物信息学软件,设计并合成针对人感染H7N9亚型禽流感病毒血凝素(H7)和神经氨酸酶(N9)基因的亚型特异性的RT-LAMP引物和环引物。缩短反应时间,实现高度特异、快速的检测目的核酸。另外,通过在反应体系中加入RT-LAMP目测荧光染料,使其反应结果可以通过目测进行判读,简单方便。其优点是:检测敏感性和特异性极高,反应时间短、操作简便、对仪器设备无特殊要求。适合对人感染H7N9亚型禽流感病毒进行快速特异的检测和早期诊断。
发明专利
CN201310211826.8
2013-05-29
CN103290144A
2013-09-11
C12Q1/70(2006.01)I
江苏省疾病预防控制中心
吴斌;葛以跃;祁贤;崔仑标;朱叶飞;汤奋扬;史智扬;周明浩
210009 江苏省南京市江苏路172号
南京苏科专利代理有限责任公司 32102
何朝旭
江苏;32
一种借助RT‑LAMP检测人感染H7N9亚型禽流感病毒的引物,包括简并引物和环引物,所述简并引物和环引物是依据现有核酸数据库中人感染H7N9亚型禽流感病毒的H7基因节段序列和N9基因节段序列分别进行同源性比对,根据保守序列,针对各基因设计而得,所述H7基因简并引物的序列为:H7‑F3TGTCTGTTATCCTGGGAAATH7‑B3AGCATTATCTGTGTTTGACAGH7‑FIP GTATGTGAATCCCATTGCTTCCTTGGTGAATGAAGAAGCTCTGAGGH7‑BIP GGAATAAGAACTAATGGARCAACCAAGCCATTTCATTTCTGCATAG;所述H7基因环引物的序列为:H7‑LF CCGCCTGATTCTCTGAGWATTTH7‑LB GCATGTAGGAGATCAGGATCTTCA;所述N9基因简并引物的序列为:N9‑F3CGAGGTCTGGATACGAGAN9‑B3TTATCYTCCTTGGGTCTTCCN9‑FIP AGCGTTTARTACAATTGTCTGACCTTTAAAAGTGCCAAATGCATTGAN9‑BIP CTGGAGTGGTTACAGTGGATCTYTCCACATAAAAACACGCTC;所述N9基因环引物的序列为:N9‑LF TGAATGGGCTTTGATCTATCATCTGN9‑LB TGGACTATTGGGCTGARGGGGAC。