一种利用单双链复合体解析真菌菌群结构的方法

摘要：

本发明涉及一种真菌菌群结构的解析方法，更具体涉及一种利用单双链复合体解析真菌菌群结构的方法。所述方法的步骤如下：提取样品中微生物总基因组DNA；基于18SrDNA片段构建单双链复合体并进行DGGE或TGGE分析；割胶回收单双链复合体并将其扩增为完整双链；对扩增到的完整双链进行测序并将测定的序列提交到NCBI上利用Blast在GeneBank数据库中进行相似性搜索；最后根据相似性得分判断对应真菌的种属。本发明解决了DGGE和TGGE这两项技术应用于真菌菌群结构解析研究中的主要不足，可以在保证分离效果的同时得到更多的序列信息用于分子鉴定，因此将会获得更加精准的真菌菌群结构信息。本发明提出的单双链复合体策略，具有简便、快捷和重现性好的优点。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN201310110305.3

申请日期：2013-04-01

公开/公告号：CN103276056A

公开/公告日：2013-09-04

主分类号：C12Q1/68(2006.01)I

申请/专利权人:福州大学

发明/设计人:倪莉;黄志清;吕晓丹

主申请人地址:350108 福建省福州市闽侯县上街镇大学城学园路2号福州大学新区

专利代理机构:福州元创专利商标代理有限公司 35100

代理人:蔡学俊

国别省市代码:福建;35

权利要求：

一种利用单双链复合体解析真菌菌群结构的方法，其特征在于：所述方法的步骤如下：提取样品中微生物总基因组DNA；基于18S rDNA片段构建单双链复合体并进行DGGE或TGGE分析；割胶回收单双链复合体并将其扩增为完整双链；对扩增到的完整双链进行测序并将测定的序列提交到NCBI上利用Blast在GeneBank数据库中进行相似性搜索；最后根据相似性得分判断对应真菌的种属。