一种3’-cDNA展示方法
本发明公开了一种3’-cDNA展示方法,步骤为:(1)以总RNA(或者mRNA)为模板,以设计合成的Oligo (dT)18V引物通过反转录合成cDNA双链;(2)将步骤(1)得到产物通过TaqⅠ内切酶进行酶切;(3)将步骤(2)产物与设计合成的“Y”形接头用T4连接酶连接;(4)以Oligo (dT)18V及TaqⅠ“Y”形接头序列设计引物进行PCR扩增。(5)变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测。本发明应用“Y”形接头与酶切片段连接,抑制非PolyA末端的cDNA扩增,让具有“Y”形接头及PolyA末端的cDNA得到指数扩增,排除了非PolyA末端cDNA的干扰,从而只扩增cDNA 3’末端序列,具有经济性好、效率高、可靠性强、冗余度低及假阳性低等优点,能够同时研究多个样本多个时期的生物体mRNA时空特异表达情况,是发掘基因的功能、探索生物发育机制等的有力工具。
发明专利
CN201210382040.8
2012-10-10
CN102994632A
2013-03-27
C12Q1/68(2006.01)I
四川省农业科学院土壤肥料研究所
贾定洪;郑林用;彭卫红;甘炳成;黄忠乾;谭伟;王波;谢丽源
610066 四川省成都市外东狮子山路4号二区
北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246
龚燮英
四川;51
一种3’‑cDNA展示方法,其特征在于,该方法的主要步骤包括:(1)以总RNA 或者mRNA 为模板,以设计合成的Oligo (dT)18V引物通过反转录合成cDNA双链;(2)将步骤(1)得到产物通过TaqⅠ内切酶进行酶切;(3)将步骤(2)产物与设计合成的“Y”形接头用T4连接酶连接;(4)以Oligo (dT)18V及TaqⅠ“Y”形接头序列设计引物进行PCR扩增;(5)变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测。