一种利用高通量测序技术发现新转录本的方法

摘要：

本发明旨在提供一种检测基因组中尚末注释的新转录本的方法。该方法对同一样本分别采用mRNA-seq及rmRNA-seq技术获得转录组全基因组数据。比较基因组区域两种技术获得的表达谱结果，做统计分析找出有显著差异的区域。针对其中表达丰度比较高差异区域，设计RT-PCR验证其生物学功能。此发明可以很好的应用于高通量筛选基因组中新转录本。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN201110435592.6

申请日期：2011-12-22

公开/公告号：CN103173523A

公开/公告日：2013-06-26

主分类号：C12Q1/68(2006.01)I

申请/专利权人:上海聚类生物科技有限公司

发明/设计人:曾华宗

主申请人地址:200333 上海市祁连山南路999弄80号801室

国别省市代码:上海;31

权利要求：

一种高通量筛选基因组中新转录本的方法，其特征在于，针对rmRNA‑seq及mRNA‑seq实验结果间存在的差异，设计数据分析流程，筛选差异区域，并设计实验验证，发现新转录本。