HLA基因型别-SNP连锁数据库、其构建方法、以及HLA分型方法

摘要：

本发明属于基因组学和生物信息领域，涉及HLA基因型别-SNP连锁数据库、其构建方法、以及HLA分型方法。具体地，所述构建HLA基因型别-SNP连锁数据库的方法，包括如下步骤：a）选择一个或多个HLA基因座的序列作为参考序列；b）将现有HLA数据库中已知型别的HLA基因与参考序列比对，找出与参考序列的差异位点即SNP位点，得到每个型别相对于参考序列的SNP连锁关系，构建HLA基因型别-SNP连锁数据库。本发明还涉及确定HLA基因的SNP连锁关系的方法，以及HLA分型装置。本发明的分型方法实现了HLA的低成本，高通量、高准确率、高分辨率的分型。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN201080070269.7

申请日期：2010-11-23

公开/公告号：CN103221551A

公开/公告日：2013-07-24

主分类号：C12Q1/68(2006.01)I

申请/专利权人:深圳华大基因科技有限公司

发明/设计人:曹红志;张伟;王煜

主申请人地址:518083 广东省深圳市盐田区北山路146号北山工业区综合楼11F-3

专利代理机构:中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038

代理人:刘海罗

国别省市代码:广东;44