CYP19A1基因SNP检测液相芯片及检测方法
本发明公开了一种CYP19A1基因SNP检测液相芯片，包括有：针对CYP19A1基因rs4646、rs10046C＞T、rs700519C＞T、rs1870050C＞A、hCV1664178A＞C、rs12900137G＞C、rs730154G＞A、rs936306T＞C、rs1902586A＞G?SNP位点分别设计的野生型和突变型特异性ASPE引物，每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列选自SEQ?ID?NO.19～SEQ?ID?NO.36；所述tag序列选自SEQ?ID?NO.1～SEQ?ID?NO.18中的序列；分别包被有特异的anti-tag序列的微球，所述anti-tag序列能相应地与所选tag序列互补配对；用于扩增具有CYP19A1基因待检测的目标序列SNP位点的引物。本发明还公开了CYP19A1基因SNP检测方法。本发明所提供的检测方法与测序法的吻合率高达100％。所制备的CYP19A1基因SNP检测液相芯片具有非常好的信号-噪声比，并且所设计的探针以及anti-tag序列之间基本上不存在交叉反应。
发明专利
CN201010105567.7
2010-01-29
CN101781684A
2010-07-21
C12Q1/68(2006.01)I
广州益善生物技术有限公司
许嘉森;李国强;杨惠夷
510663 广东省广州市广州科学城揽月路80号广州科技创新基地B、C区五层
广州华进联合专利商标代理有限公司 44224
万志香%曾旻辉
广东;44
一种CYP19A1基因SNP检测液相芯片，其特征是，主要包括有：A.针对CYP19A1基因的SNP位点分别设计的野生型和突变型特异性ASPE引物，每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端的针对目的基因SNP位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列分别选自：针对rs4646G＞T的SEQ?ID?NO.19和SEQ?ID?NO.20、针对rs10046C＞T的SEQ?ID?NO.21和SEQ?ID?NO.22、针对rs700519C＞T的SEQ?ID?NO.23和SEQ?ID?NO.24、针对rs1870050C＞A的SEQ?ID?NO.25和SEQ?ID?NO.26、针对hCV1664178A＞C的SEQ?ID?NO.27和SEQID?NO.28、针对rs12900137G＞C的SEQ?ID?NO.29和SEQ?ID?NO.30、针对rs730154G＞A的SEQ?ID?NO.31和SEQ?ID?NO.32、针对rs936306T＞C的SEQ?ID?NO.33和SEQ?ID?NO.34、针对rs1902586A＞G的SEQ?ID?NO.35和SEQ?ID?NO.36中的一对或一对以上；所述tag序列选自SEQ?ID?NO.1～SEQ?ID?NO.18中的序列；B.分别包被有特异的anti-tag序列的微球，所述anti-tag序列能相应地与A中所选tag序列互补配对，所述anti-tag序列选自SEQ?ID?NO.37～SEQ?ID?NO.54中的序列，所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列，上述每种微球具有不同颜色编码；C.用于扩增具有rs4646G＞T、rs10046C＞T、rs700519C＞T、rs1870050C＞A、hCV1664178、rs12900137G＞C、rs730154G＞A、rs936306T＞C、rs1902586A＞G中的一个或一个以上SNP位点CYP19A1基因目标序列的引物。