（β/α）8或（α/β）8结构种类生物酶pH的全息酶工程方法

摘要：

本发明公开了一种(β/α)8或(α/β)8结构种类生物酶pH的全息酶工程方法，其特征在于：其方法如下，首先在数据库中搜索相关蛋白质序列，并查找相关序列对应酶的最适pH值，进行相关性分析，确定与木聚糖酶碱适应性相关的二肽，找到相关氨基酸在序列和结构中的位置；分析相近氨基酸和酶活性中心，在保持酶活性的前提下，对与木聚糖酶碱适应性相关的氨基酸进行定点突变，获得碱适应性提高的木聚糖酶。本方法是对酶pH进行的理性设计方法，是对随机突变方法的全面革新，是在理论指导下进行的定点突变，目的明确、效果明显，提高实验成功率，减轻盲目突变对人、财、物的大量耗费。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN200610128497.0

申请日期：2006-12-29

公开/公告号：CN101210233

公开/公告日：2008-07-02

主分类号：C12N9/00(2006.01)I

申请/专利权人:河南农业大学

发明/设计人:刘亮伟;陈红歌;刘新育;张世敏;王明道

主申请人地址:450002河南省郑州市文化路95号

专利代理机构:郑州中原专利事务所有限公司

代理人:霍彦伟

国别省市代码:河南;41

权利要求：

1. 一种(β/α)8或(α/β)8结构种类生物酶pH的全息酶工程方法，其特征在于：其方法如下，首先在数据库中搜索相关氨基酸序列，并查找相关序列对应酶的最适pH值，进行相关性分析，即计算各个氨基酸序列中氨基酸含量，将氨基酸含量同酶pH进行相关性分析，得到与pH相关的氨基酸；进一步，计算氨基酸二肽含量，将二肽含量与pH进行相关性分析，得到与pH相关性二肽，确定与蛋白质酸碱适应性相关的二肽，通过二肽可以在蛋白质序列中确定位置，进一步，用分子结构模拟软件模拟要改造酶的结构，从二肽在序列中的位置查找在结构中的位置，找到相关氨基酸在序列和结构中的位置；分析相近氨基酸和酶活性中心，在保持酶活性的前提下，对与蛋白质具有相似(β/α)8或(α/β)8结构种类的水解酶酸碱适应性相关的氨基酸进行定点突变，即将与所要得到的pH相反作用的氨基酸突变为与pH起一致作用的氨基酸，获得酸碱适应性合适的酶或蛋白质。