中国葡萄属野生种毛葡萄抗黑痘病候选基因序列及应用
本发明涉及毛葡萄常规杂交育种、分子标记辅助育种、基因定位与作图及基因克隆的方法与技术。采用抗病基因同源序列法(Resistant geneanalogus,RGAs)获得中国葡萄属野生种毛葡萄(V.quinquangularis Read)南郑-1、泰山-12、83-4-96等3个株系抗黑痘病候选基因DNA片段26个,对这些片段克隆测序后,其大小介于492bp~550bp之间。以这些序列为依据,可以进行毛葡萄抗黑痘病标记辅助育种,用作葡萄育种中检测毛葡萄抗黑痘病基因的探针;可以根据这些片段在毛葡萄与欧洲葡萄杂种后代中的分离情况,进行抗黑痘病基因定位与作图;也可以根据这些片段设计特异引物,采用cDNA末端快速扩增技术(Rapid amplification of cDNA ends,RACE)(Frohman et al,Proc.Natl.Acad.Sci,1988)克隆毛葡萄抗黑痘病基因,为通过基因工程改良葡萄品种的抗病性奠定基础。
发明专利
CN200510041756.1
2005-03-07
CN1683536
2005-10-19
C12N15/29
西北农林科技大学
王跃进;王西平
712100陕西省杨凌示范区邰城路3号
西安通大专利代理有限责任公司
李郑建
陕西;61
1.中国葡萄属野生种毛葡萄抗黑痘病候选基因序列,其特征在于,包括南郑-1株系、泰山-12株系、83-4-96株系共26个中国葡萄属野生种毛葡萄的抗黑痘病候选基因序列,这些抗黑痘病候选基因序列分别是:1)南郑-1株系的11个抗黑痘病候选基因序列:毛葡萄南郑-1(2)1GGTGTTGGGAAGACAACTTTCGCCAAAGAAGTTTACGACAACCAGAGAGTGGTGGGACAC61TTCGATTGCCATGCTTGGGTCACTGTGTCTCAATCATTCAAGATGGAAGAGCTACTACGG121AACATGACAAAGAAATTCTATCAGGGAAGAAAGGAAGCAGTTCCTGAGGGTATCGATACA181ATAGACGAGATGTCACTGATTGCCTTAATCAGGCAGTATTTACAAGATAAAAGGTATGTG241GTTGTTTTTGATGATGTATGGAAACTAGATTTCTGGGGATTTATTAAATATGTTTTACCA301GAAAATGGGAAGGGCAGTAGGATAATAATCACTACACGTAATGATGAGGTAGCCTCTTCT361TGCAAAGAGTCGTCATTTGATTACATCCACAAGCTGCAACCCCTGTCCCCAAAGAGTTCC421TGGGAACTCTTTTGCAAGAAGACATTCCAGAGAGGATGTCCTCCAGAGTTGGAGAAACTG481TCTCTTGATATTGTCAAAAGATGTGGAGGATTGCCACTAGCGTTG毛葡萄南郑-1(6)1GGGGTTGGGAAGACAACGCTCGCACGGCTTGTTTACAATGATGATTTGGCCAAAAATTTT61GAACTAAAAGCGTGGGTTTGTGTGACTGATGTGTTTGATGTGGAGAATATAACAAAAGCA121ATTCTCAATTCGGTGTTAAATTCTGATGCAAGCGGCTCTTTGGACTTCCAACAAGTTCAA181CGGAAATTGACAGTCACATTAGCAGGGAAAACTCTTTTACTCATTCTAGATGACGTGCGG241AACGAAAATTATTGTAATTGGGATCGTTTGCGGGCTCCTTTGAGTGTAGTGGCAAAAGGA301AGCAAAGTCATAGTTACAACACGCAATAAAAATGTTGCATTGATGATGGGAGCTGCCAAG361AATGTTCATGAACTAAACCCTTTATCTGAAGATGATTGTTGGTCTGTGTTTGAGAAGCAT421GCATTTGAACATAGAAATATCAATGATCGTCCGAATCTGGTGTCCATTGGTAGGAAAATT481GTTGCCAAATGTGGTGGATTGCCACTAGCGTTG毛葡萄南郑-1(1)1GGTGTTGGCAAGACAACCTTAGCAAAGTTAGTCTACAATAATAATGCTGTTGTTGATCAT61TTCCCTTATTGTGCTTTTGTGTCTTGTAACTATAAGGGAAGCTCTCGAGGTCATAGCTAA121ACAAATGGGCAATCCAAGTGCATGGAAAGAAGACAACAGAAGCAATGTAGAAAAAGCAGA181AGTGGAAGGGTAATGGTCTGAAGAAGGCTCTTGGTCACAACGAGTGAAGTCGATGCCTTC241TTTAAAAACTTTCTTGAAGAATAAGAAGCATCTTATAGTTTTGGATGACATAGAAATGGA301TGCTGGCTTGAATATCTTGCTTAGCAAACTCCCAAAAACATCAAATGGGAGTCGGATGAT361CTTGACCACTCGGTATGCGAGGGGACTTGCAGATCTACAGAAGAAGGGCACTAATCTAAC421ACTGCAATTACATGATGATGATGAGAGTTGGATGCTGTTCAAACATATTTTGAAGGTAGA481CATACCCCAAGAACTGATATATCTTAGAAGAGACATTGTGACAACATGCTGTGGATTGCC541ACTAGCGTTG毛葡萄南郑-1(12)1GGGGTTGGGAAGACTACCCTCATGACCCAAGTCAACAACGAGTTCCTTAAAACTATTCAT61CAATTTGACATAGTGATTTGGGTTGTGGTTTCCAGAGACCCAAATCCCGAAAAGGTTCAG121GATGAAATTTGGAAGAAGGTAGGGTTTTGCGATGATATATGGAAAAGCAAAAGCCAAGAT181GAGAAAGCCATTAGCATATTCAGGATCCTGGGCAAGAAAAAGTTTGTTTTGTTCTTGGAT241GATGTGTGGGAGCGGTTTGATCTCTTAAAGGTGGGGATTCCACTGCCAAACCAACAAAAT301AATTCCAAGGTTGTATTTACGACACGATCTGAAGAGGTTTGTGGCCGCATGGGAGCTCAC361AGGCGAATAAAAGTTGAGTGTTTGGCATGGAAGCAAGCCTGGGACTTGTTTCAAAACATG421GTAGGAGAAGATACCCTTAATTCTCATCCTGAAATACCTCAGCTAGCTGAAACTATTGTG481AAGGAGTGTCTCGGATTGCCACTAGCGTTG毛葡萄南郑-1(14)1GGGGTTGGTAAGACTACGCTCGCACGGCTTGTTTACAATGATGATTTGGCCAAAAATTTT61GAACTAAAAGCGTGGGTTTGTGTGACTGAGGTTTTTTATGTGGAGAATATAACAAAAGCA121ATTCTCAATTCGGTGTTAAATTCTGATGCAAGTGGCTCTTTGGACTTCCAACAAGTTCAA181AAGAAATTGACAGACACTTTAGCAGGGAAAACTCTTTTTCTCATTCTAGACGACGTGTGG241AACGAAAATTATTGTAATTGGGATCGTTTGCGGGCTCCTTTGAGTGTAGTGGCAAAAGGA301AGCAAAGTCATAGTTACAACACGCAATAAAAATGTTGCATTGATGATGGGAGCTGCCGAG361AATGTTCATGAACTAAACCCCTTATCAGAAGATGCTTGTCGGTCTGTGTTTGAGAAGCAT421GCATTTGAACATAGGAATATGAAAGATCATCCAAACTTGGTGTCCATTGGTAGGAAAATT481GTTGGCAAGTGTGGGGGATTGCCACTAGCGTTG毛葡萄南郑-1(16)1GGAGTTGGCAAGACTACTTTCGCCAAAGAAGTTTACGACAACCAGAGAGTGGTGGGACAC61TTCGATTGCCATGCTTGGGTCACTGTGTCTCAATCATTCAAGATGGAAGAGCTACTACGG121AACATGACAAAGAAATTCTATCAGGGAAGAAAGGAAGCAGTTCCTGAGGGTATCGATACA181ATAGACGAGATGTCACTGATTGCCTTAATCAGGCAGTATTTACAAGATAAAAGGTATGTG241GTTGTTTTTGATGATGTATGGAAACTAGATTTCTGGGGATTTATTAAATATGTTTTACCA301GAAAATGGGAAGGGCAGTAGGATAATAATCACTACACGTAATGATGAGGTAGCCTCTTCT361TGCAAAGAGTCGTCATTTGATTACATCCACAAGCTGCAACCCCTGTCCCCAAAGAGTTCC421TGGGAACTCTTTTGCAAGAAGACATTCCAGGGAGGATGTCCTCCAGAGTTGGAGAAACTG481TCTCTTGATATTGTCAAAAGATGTGGAGGATTGCCACTAGCGTTG毛葡萄南郑-1(18)1GGTGTGGGGAAAACAACGCTCGCACGGCTTGTTTACAATGATGATTTGGCCAAAAATTTT61GAACTAAAAGCGTGGGTTTGTGTGACTGATGTGTTTGATGTGGAGAATATAACAAAAGCA121ATTCTCAATTCGGTGTTAAATTCTGATGCAAGTGGCTCTTTGGACTTCCAACAAATTCAA181AGGAAATTGACAGACACGTTAGCAGGGAAAACTCTTTTTCTCATTCTAGACGACGTGTGG241AACGAAAATTATTGTAATTGGGATCGTTTGCGGGCTCCTTTGAGTGTAGTGGCAAAAGGA301AGCAAAGTCATAGTTACAACACACAAAAAAAATGTTGCATTGATGATGGGAGCTGCCAAG361AATGTTCATGAACTAAACCCTTTATCTGAAGATGATTGTTGGTCTGTGTTTGAGAAGCAT421GCATTTGAACATAGAAATATCAATGATCATCCGAATCTGGTGTCCATTGGTAGGAAAATT481GTTGGCAAATGTGGTGGATTGCCACTAGCGTTG毛葡萄南郑-1(3)1GGGGTAGGTAAGACAACTCTCGCACGGCAGGTTTACAAGTATGATTTGGCCAAAAATCTT61GAACTAAAAGCGTGGGTTTGTGTGACTGATGTGTTTGATGTGGAGAATATAACAAAAGCA121ATTCTCAATTCGGTGTTAGAGTCTGATGCAAGTGGCTCTTTGGACTTCCAACAAGTTCAA181AAGAAATTGACAGACACGTTAGCAGGGAAAACTTTTTTACTCGTTCTAGACGACGTGTGG241AACGAAAATTGTGGTCATTGGGATCTTTTGCGGGCTCCTTTGAGTGTAGGGTCCAAAGGA301AGCAAAGTCATAGTTACAACACGCAATAAAAATGTCGCATTGATGATGGGAGCTGCTAAG361AATGTTCATGAACTAAACCCTTTATCTGAAGATGCTTGTTGGTCTGTGTTTGAGAAGCAT421GCATTTGAACATAGAGATATCAATGATCATCCGAACCTGGTGTCCATTGGTAGGAAAATT481GTTGGCAAATGTGGTGGATTGCCACTAGCGTTG毛葡萄南郑-1(4)1GGGGTGGGGAAGACAACGCTCGCACGGCTTGTTTACAATGATGATTTGGCCAAAAATTTT61GAACTAAAAGCGTGGGTTTGTGTGCCTGATGTGTTTGATGTGGAGAATATAACAAAAGCA121ATTCTCAATTCGGTGTTAGATTCTGATGCAGGCGGCTCTTTGGACTTCCAACAAGTTCAA181CGGAAATTGACAGTCACATTAGCAGGGAAAACTCTTTTACTCATTCTAGATGACGTGCGG241AACGAAAATTATTGTAATTGGGATCGTTTGCGGGCTCCTTTGAGTGTAGTGGCAAAAGGA301AGCAAAGTCATAGTTACAACACGCAAAAAAAATGTTGCATTGATGATGGGAGCTGCCAAG361AATGTTCATGAACTAAACCCTTTATCTGAAGATGATTGTTGGTCTGTGT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