微型原甲藻的检测探针

摘要：

一种微型原甲藻的检测探针，属于核酸检测领域。用于对该藻进行S1酶保护分析和夹心杂交检测，具体包括三条相互关联的寡核苷酸探针：S1酶保护分析探针，在进行生物信息学比对分析时，仅与微型原甲藻核糖体大亚基430～520区域核苷酸互补，而与其它藻核糖体RNA无同源性，长度为58bp，在一定的条件下可特异性结合于微型原甲藻的rRNA上，序列为：5’-ACAGTCCGCAAATGAGTTCTGCCAAGGCTATTCACTCACCCGTAGACGAGCTACCATGA。本发明探针适用性好，大大方便了特异探针的寻找和实现。本发明的稳定性远远高于夹心杂交技术。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN200410067805.4

申请日期：2004-11-04

公开/公告号：CN1635152

公开/公告日：2005-07-06

主分类号：C12Q1/68

申请/专利权人:上海交通大学%中国海洋大学

发明/设计人:李荣秀;于志刚;蔡青松;米铁柱;甄毓

主申请人地址:200240上海市闵行区东川路800号

专利代理机构:上海交达专利事务所

代理人:王锡麟%王桂忠

国别省市代码:上海;31

权利要求：

1.一种微型原甲藻的检测探针，其特征在于，用于对该藻进行S1酶保护分析和夹心杂交检测，具体包括三条相互关联的寡核苷酸探针：S1酶保护分析探针、抓捕探针、信号探针或者连接探针，所述的S1酶保护分析探针，是指与微型原甲藻rRNA互补而且用于S1酶保护分析方法的寡核苷酸探针，所述的抓捕探针，是指与S1酶保护分析探针的一端结合，这一端通常为3’端，另外一端标记有生物素，从而将经过S1酶酶切处理和变性处理后保留在溶液中的S1酶保护分析探针捕获下来的探针，所述的信号探针或者连接探针能够在抓捕探针捕获S1酶保护分析探针后，结合于S1酶保护分析探针的另一端的的探针为连接探针，同时该探针标记有可检测信号，或者在一端具有信号探针结合区，能够与通用信号探针互补。