大黄鱼线粒体分子标记及用于养殖群体与野生种群的鉴别
大黄鱼线粒体分子标记及用于养殖群体与野生种群的鉴别。鉴别大黄鱼养殖群体与野生种群的线粒体分子标记为4个碱基的差异。鉴别步骤为设计合成一对保守引物L14841：5′-CCATCCAACATCTCAGCATGATGAAA-3′；H15149：5′-GCCCCTCAGAATGATATTTGT CCTCA-3′；对养殖与野生种群的线粒体DNA中细胞色素B(cyt b)基因进行PCR扩增；扩增结果经纯化；测序，对比测序结果。由4个群体大黄鱼mtDNA Cytb基因324bp序列排序结果可以看出大黄鱼养殖群体与野生群体存在4个碱基的差异，表现为1个颠换，3个转换。其结果稳定，可重复性强。3个野生群体的扩增结果一致。4个碱基的差异可作为区分养殖与野生群体的分子标记。鉴别方法简单。
发明专利
CN200410060149.5
2004-06-28
CN1587419
2005-03-02
C12Q1/68
厦门大学
苏永全;王德祥;王军;丁少雄;覃映雪
361005福建省厦门市思明南路422号
厦门南强之路专利事务所
马应森
福建;35
1、鉴别大黄鱼养殖群体与野生种群的线粒体分子标记为NDHYCTACTCGCCCTCTGTCTAGGCGCCCAAATCCTCACAGGACTCTTCCTCGCTATACACTAC60DDHY************************************************************60MDHY************************************************************60YDHY********************************************************T***60ruler1.......10........20........30........40........50........60NDHYACATCCGACGTCACCATGGCCTTTTCATCTGTCGCACACATCTGCCGTGACGTAAACTAC120DDHY************************************************************120MDHY************************************************************120YDHY*****G******************************************************120ruler........70........80........90.......100.......110.......120NDHYGGGTGACTCATCCGAAATCTCCACGCTAATGGTGCCTCTTTCTTTTTCATCTGCCTCTAC180DDHY************************************************************180MDHY************************************************************180YDHY************************************************************180ruler.......130.......140.......150.......160.......170.......180NDHYCTCCATATTGGCCGAGGCCTCTACTATGGCTCCTATCTTTACAAAGAGACATGAAACATC240DDHY************************************************************240MDHY************************************************************240YDHY******************************************C*****************240ruler.......190.......200.......210.......220.......230.......240NDHYGGAGTCGTACTCTTTCTCCTTGTAATAATGACCGCTTTTGTTGGCTATGTGTTACCTTGA300DDHY************************************************************300MDHY************************************************************300YDHY**************************************************A*********300ruler.......250.......260.......270.......280.......290.......300NDHYGGACAAATATCATTCTGAGGGGCA324DDHY************************324MDHY************************324YDHY************************324ruler.......310.......320....其中“*”表示相同的碱基序列位点，NDHY：海南沿海硇洲族野生大黄鱼；DDHY：浙江、江苏沿海岱衢族野生大黄鱼；MDHY：福建、广东东部沿海闽粤东族野生大黄鱼；YDHY：闽粤东族养殖大黄鱼。