一种真核生物蛋白质的亚细胞定位方法

摘要：

本发明涉及生物信息学技术领域的一种真核生物蛋白质的亚细胞定位方法。包括两部分：1.最优分类器的获得。2.新的蛋白质序列亚细胞位置的预测。亚细胞位置分为八种，允许用户输入未知亚细胞位置的蛋白质氨基酸残基序列，输出为本系统预测出来的该序列的亚细胞位置。本发明首先针对给定的训练数据集对分类器进行训练，然后通过交叉实验确定出分类器的最优参数，最后得到针对亚细胞定位问题的最优分类器，这时就可以对未知亚细胞位置的蛋白质序列进行亚细胞定位了。本发明可以快速实现蛋白质序列的亚细胞定位，定位准确度比较高，同时也可以实现大批量蛋白质序列的亚细胞定位。

专利类型：发明专利

申请/专利号：CN200310123333.5

申请日期：2003-12-17

公开/公告号：CN1629307

公开/公告日：2005-06-22

主分类号：C12Q1/04

申请/专利权人:中国科学院自动化研究所

发明/设计人:崔庆华;蒋田仔

主申请人地址:100080北京市海淀区中关村东路95号

专利代理机构:中科专利商标代理有限责任公司

代理人:周国城

国别省市代码:北京;11

权利要求：

1、一种真核生物蛋白质的亚细胞定位方法，基于1-v-1多分类支持向量机的八个亚细胞位置的蛋白质序列亚细胞定位。