梁山慈竹BABY BOOM基因的克隆与表达分析

摘要：

以梁山慈竹Dendrocalamus farinosus转录组数据库为基础,采用同源克隆技术从梁山慈竹笋中克隆到1个BABY BOOM(BBM)基因,命名为DfBBM,其开放阅读框长度为1101 bp,推测编码366个氨基酸残基.蛋白功能域预测分析表明,DfBBM基因含有AP2结构域,证明该基因确实属于AP2/ERF转录因子家族基因之一;进化树分析发现,DfBBM基因与玉米的BBM2以及山羊草和旱麦草的BBM基因在一个分支上,序列高度相似;保守结构域分析发现,DfBBM和ZmBBM2,AeBBM1,EtBBM之间含有8个保守基序,这可能有助于研究DfBBM和其他物种BBM基因的相似功能.DfBBM的三级结构预测和乙烯反应性转录因子ERF096模型高度相似.组织表达分析表明,DfBBM基因在梁山慈竹展开叶和笋尖表达较高,DfBBM基因对ABA、IAA、NAA和MeJA激素处理均有响应,其中ABA、IAA和MeJA激素处理2 h后其表达量上升达到最高值,随后开始下降;而在NAA激素处理后其表达则明显下降.

关键词：梁山慈竹、BBM基因、克隆、生物信息学、表达模式

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资助基金：四川省"十三五" 重点攻关项目2016NYZ0038;四川省重点研发项目2017NZ0008;四川省应用基础研究项目18YYJC0920;西南科技大学研究生创新基金18ycx028

在线出版日期：2019-11-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：24-31