基于网络药理学和分子对接探讨五指毛桃汤防治COVID-19的作用机制

摘要：

运用网络药理学和分子对接的思路和方法,研究五指毛桃汤预防新冠肺炎(Coronavirus disease 2019,COVID-19)的作用机制.从ETCM、TCMSP、SwissADME、SwissTargetPrediction等数据库和文献中获取五指毛桃汤各味中药的主要有效成分和作用靶点,导入Cytoscape 3.8.0 软件绘制药物有效成分-靶点网络图.通过TTD、GeneCards、OMIM、DrugBank、pharmgkb等数据库筛选疾病基因,将疾病基因与靶点基因取交集,通过STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)关系图,筛选得到核心基因.利用R语言软件编辑脚本文件进行GO功能和KEGG通路分析.最后,利用AutoDock4 及Pymol 2.2.0 平台进行分子对接分析,预测活性化合物与关键靶点的亲和力.五指毛桃汤PPI关系图涉及 7 味中药、155 个活性成分和 749 个靶基因.五指毛桃汤作用于COVID-19 的核心靶点基因为信号转导和转录激活因子 1(STAT1)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶 Src(SRC)、信号转导和转录激活因子 3(STAT3)、丝裂原活化蛋白激酶 3(MAPK3)、AKT 丝氨酸/苏氨酸激酶 1(AKT1)和丝裂原活化蛋白激酶 1(MAPK1).GO功能分析富集到 5023 条生物过程、462 条细胞组成、738 条分子过程;KEGG通路分析富集到 173条信号通路.分子对接验证显示,活性成分槲皮素、山奈酚、环桑色烯与SRC、MAPK1、MAPK3、AKT1、STAT1 等靶点基因显示出良好的结合力;环桑色烯与SARS-CoV-23Clike蛋白具有良好的结合力.五指毛桃汤关键活性成分槲皮素、山奈酚、异鼠李素等可能通过作用SRC、MAPK1、STAT3、MAPK3、AKT1、STAT1 等核心靶点及SARS-CoV-23Clike蛋白,调控T细胞受体信号通路和IL-17 信号通路等免疫途径,抑制病毒感染,发挥预防COVID-19 的作用.

关键词：新冠肺炎、五指毛桃汤、网络药理学、分子对接

所属期刊栏目：7

分类号：S859.3(动物医学（兽医学）)

资助基金：河南省科技攻关项目;河南省国家级大学生创新创业训练计划项目;河南省省级大学生创新创业训练计划项目

在线出版日期：2023-10-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：44-55