枣树全基因组MITEs成分分析与系统进化研究

摘要：

微型反向重复转座基因( minialure inverted repeat transposable elements, MITEs)的演化可能是造成枣树基因组及品种多样性的重要原因.为研究MITEs在枣树全基因组中的分布、种类及演化,使用MITE预测软件( MITE-Digger)识别枣树全基因组中的MITEs序列,在植物MITEs数据库中进行分类注释,并用MEGA 6.0构建枣树基因组中MITEs的系统进化树.结果显示,MITE-Digger检测出MITEs总共3230条,碱基数为1104679 bp,占基因组比例为0.34%；其中共有948条在植物MITEs数据库中比对到相似序列,这些MITEs可以归类到5个家族：hAT,PIF/Harbinger,CACTA,Mutator和Tc1/Mariner,MITEs系统进化树显示：枣树基因组中MITEs来源于少数几个共同祖先,在长期的进化中有明显的扩增和突变,这可能与枣树品种多样性有关.研究结果将为枣树的遗传资源及育种研究提供重要参考.

关键词：MITEs、枣树基因组、系统进化、IMP分子标记技术

分类号：Q949.4(植物学)

资助基金：NSFC-河南人才培养联合基金资助项目,编号U1204307;河南省高等学校重点科研项目,编号15A2100410;洛阳师范学院省级培育项目,编号2010-PYJJ-007

在线出版日期：2016-03-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：103-107