基于胃癌关键基因的中药抗肿瘤研究现状分析

摘要：

目的 分析以胃癌关键基因为治疗靶点的中药在胃癌防治中的研究现状.方法 在GEO数据库中下载胃癌基因表达谱芯片数据,经筛选后确定GSE54129和GSE64916两个数据集,以"P＜0.05,Log2FC≥1"为截断值进行肿瘤组织与正常组织的差异表达基因筛选,利用韦恩图取两个数据集的交集,进行基因本体论(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析及差异表达基因的蛋白互作(PPI)网络分析,采用Cytoscape(3.8.2版本)软件计算得出的关键基因,在Coremine Medical数据库中对关键基因进行检索,在"traditional Chinese medicine"条目中得到以关键基因作为治疗靶点的中药.对得到的中药进行频次统计,选择前5味中药,在中文及外文数据库中对其在胃癌中的相关研究进行文献检索.将检索到的文献分为临床研究、网络药理学分析、数据挖掘/处方经验、基础实验,对研究现状进行总结.结果 韦恩图取交集后得到两个数据集有150个共同的差异表达基因,富集到的生物功能与通路主要有PI3K/AKT通路、上皮细胞转移、胶原蛋白细胞外基质等.利用String绘制PPI网络,进一步在Cytoscape中根据自由度大小选出前 10位的关键基因:CDKN2A,SPP1、CTGF、C3、CST3、APOB、GC、IL18、CCND1、CD34.应用Coremine medical数据库分析得到治疗关键基因靶点的中药,对检索到的中药进行频次统计,出现频次最高的前五味中药分别为黄芪(与9个基因有关),白花蛇舌草、淫羊藿、三七(各与4个基因有关),菝葜(与3个基因有关).外文数据库未检索到相关文献,于2022年2月20日在中文CNKI数据库分别以"胃癌""胃恶性肿瘤"and"黄芪""白花蛇舌草""淫羊藿""三七""菝葜"进行检索,仅中药黄芪有临床研究,共49篇;网络药理学分析中黄芪有8篇,白花蛇舌草3篇,其他中药未检索到;数据挖掘/处方规律研究中黄芪21篇,白花蛇舌草4篇,其他中药未检索到;基础实验中黄芪35篇,白花蛇舌草15篇,三七6篇,淫羊藿3篇,菝葜4篇,其中黄芪与三七有一项基础实验研究重合.临床研究多涉及黄芪提取物注射液联合其他治疗对患者临床疗效及不良反应的影响;网络药理学分析中,包括的药对有黄芪-党参/白术/莪术/女贞子、白花蛇舌草-半枝莲等;数据挖掘多集中在黄芪、白花蛇舌草两味中药;基础实验研究多以药物单体为主.结论 治疗胃癌组织与正常组织的关键差异表达基因靶点的中药主要有黄芪、白花蛇舌草、三七、淫羊藿、菝葜,目前以黄芪的相关研究最多.

关键词：胃癌、基因芯片、生物信息分析、关键基因

所属期刊栏目：63

分类号：R286;R979.1;R730

资助基金：国家重点研发计划;国家科技重大专项

在线出版日期：2023-02-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2239-2245