基于生物信息学的慢性胃炎-胃癌“炎癌转变”关键基因与通路研究

摘要：

目的 使用生物信息学方法,从分子水平揭示慢性胃炎-胃癌“炎癌转变”关键基因与通路,以揭示胃癌的发病机制.方法 从GEO数据库中下载GSE55696基因芯片数据,利用R语言Limma包筛选出慢性胃炎→异型增生→胃癌间共同表达的差异基因,进行GO和KEGG通路富集,并构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,以明确其关键基因.结果 慢性胃炎-胃癌过程的共同差异基因有57个,均为上调基因.GO和KEGG分析显示,差异表达基因分别富集于16条生物过程条目和4条信号通路.PPI网络模块鉴定出8个关键蛋白,分别为IL8、FPR1、FCGR3A、S100A8、S100A9、CXCR2、MMP9、CCL3.结论 本研究所鉴定的差异表达基因和通路可促进对慢性胃炎-胃癌“炎癌转变”机制的理解,并且可能成为胃癌诊断和预防的分子生物标记物,并为中医药改善慢性胃炎,阻断“炎癌转变”提供新的思路.

关键词：生物信息学、胃癌、慢性胃炎、胃癌前病变、基因、通路

所属期刊栏目：38

分类号：R735.2(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金

在线出版日期：2020-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：147-151,后插18