肺癌脾虚痰湿型肿瘤相关证候差异表达基因的筛选与鉴定
目的:构建脾虚痰湿型肺癌肿瘤相关消减cDNA文库,以寻找脾虚疫湿型肺癌证候特异基因.方法:以原发性肺癌脾虚痰湿型的患者肿瘤组织及瘤旁正常组织为材料,分离Poly(A)RNA,反转录合成单链及双链cDNA,经Rsa Ⅰ酶切,将肿瘤组织cDNA分成两组,分别与两种不同的接头连接,再与正常肺组织cDNA进行两次消减杂交和两次押制性PCR扩增,将第两次PCR产物与pGEM-T载体连接,转化大肠杆菌DH 5α感受态细胞进行文库扩增,构建了消减cDNA文库,同法建立反向消减cDNA文库.对经反向斑点杂交验证,从cDNA文库中随机挑选的200个含差异片段的克隆,碱裂解法提取DNA,从克隆5'端进行单向测序.EST测序序列行生物信息学分析,所有基因聚类用BLASTX(E values＜10-5)和BLASTN(E values＜10-10)搜索GenBank的非冗余核酸序列数据库及蛋白质库予以注释.结果:经文库扩增,随机挑选克隆进行PCR鉴定,插入片段主要分布在250～1000bp之间,并以反向斑点杂交法进一步验证其阳性克隆,最终获得251个阳性克隆,其中正向消减文库获得165个阳性克隆,反向消减文库获得86个阳性克隆.测序发现了正向消减文库差异基因22个,反向消减文库差异基因6个.结论:成功构建脾虚痰湿型肺癌肿瘤相关消减cDNA文库,发现了那些有明确生物学功能的证候相关基因,其基因表达及分布特征初步反映了肺癌脾虚痰湿型在分子层面的证候特点.
肺癌、脾虚痰湿型、证候基因、抑制性消减杂交、cDNA文库、表达序列标签、转录组、差异表达
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R285.5(中药学)
广东省中医药局科研课题;广东省自然科学基金
2011-03-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
2539-2543
