基于网络药理学和分子对接的异喹啉生物碱肝毒性机制初探

摘要：

目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨异喹啉生物碱(IAs)肝毒性(HT)的可能作用机制.方法:通过互联网科学数据库the web of science,PubMed,ScienceDirect,Geenmedical收集IAs的候选毒性化合物和靶点;从Genecards Database中获得HT相关靶点,并利用STRING数据库对IAs肝毒性的靶点基因进行分析;Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,CytoHubba插件筛选核心基因;通过Bioinformatics网站对IAs肝毒性的靶点基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.最后,使用Auto dock软件对核心毒性化合物和核心基因进行分子对接验证,并用pymol软件就对接结果进行3D可视化分析.结果:互联网科学数据库显示有13种IAs活性成分存在HT;PPI网络和核心靶点分析表明ANXA5、CASP3、CCL5、IL2和PPARG是HT的关键靶点.GO和KEGG分析显示,IAs可通过癌症途径、癌症中的蛋白多糖以及癌症中的微小RNA等通路参与过氧化氢的反应、凋亡过程的正调控等多种生物学过程.此外,分子对接方法证实了IAs的13种生物活性分子与HT靶点高度亲和,其结合活性可能受到化学结构中五碳环所处的位置,所连的基团,以及是否闭环有影响.结论:通过网络药理学和分子对接,从IAs的活性化合物可能通过作用于5个核心基因以及33条信号通路导致肝毒性.

关键词：异喹啉生物碱、肝毒性、网络药理学、分子对接

所属期刊栏目：13

分类号：R285.5(中药学)

资助基金：成都中医药大学青基人才专项No.QJRC2021012

在线出版日期：2023-04-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：44-50,69