基于RNA-Seq技术初步探索顺铂在口腔鳞状细胞癌的相关耐药机制

摘要：

目的 探索口腔鳞状细胞癌(简称口腔鳞癌)顺铂化疗耐药的相关基因及信号通路.方法 建立顺铂诱导的口腔鳞癌细胞耐药模型,将顺铂耐药细胞(HN6-R)与非顺铂耐药细胞(HN6-WT_Control)进行转录组RNA-Seq测序分析,筛选两组中差异表达的基因(DEGs),利用生物信息学方法分析差异基因及相关信号通路.结果 测序结果显示顺铂耐药细胞与非顺铂耐药细胞有216个基因发生显著变化(log2Fold Change,log2FC＞1;adjusted P value＜0.05),其中55个基因下调,161个基因上调.对耐药细胞中上调的基因进行了基因富集分析(GSEA)确定了潜在的耐药相关通路,其中包括IL6/JAK2/STAT3信号通路、TNF-α和NF-κB信号通路、低氧通路、干扰素-γ应答和干扰素-α的应答通路等,其中变化最显著的基因为CXCL10、CXCL11、NR4A3和IGFBP3等.结论 IL6/JAK2/STAT3等信号通路在口腔鳞癌顺铂耐药细胞株中显著上调,可能成为预测口腔鳞癌化疗疗效的标志物及潜在的治疗靶点.

关键词：口腔鳞癌、顺铂、化疗、耐药、差异基因、生物信息学

所属期刊栏目：47

分类号：R739.81(肿瘤学)

资助基金：深圳市科技创新委员会基础研究重点项目NO:JCYJ20220818102816036

在线出版日期：2024-02-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：53-61