基于叶绿体DNA序列的多基原黄精分子鉴定

摘要：

目的:通过分析rpl20-rps12、trnL-trnF及psbA-trnH序列变异特点,评价其对3种不同基原黄精的鉴定能力.方法:分别提取3种基原黄精总DNA,以rpl20-rps12、trnL-trnF及psbA-trnH引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和测序.采用MEGA 5软件寻找其特异位点,计算样品K2-P(Kimura 2-parameter)遗传距离,并构建邻接(neighbor-joining,NJ)系统聚类树.结果:rpl20-rps12、trnL-trnF及psbA-trnH序列长度分别为722～737、293、457～531 bp,简约信息位点占比分别为0.4％、1.0％和2.4％.rpl20-rps12和psbA-trnH序列中种内最大遗传距离均小于种间最小遗传距离.基于3个序列构建的NJ树显示,3种基原黄精都表现出良好单系性,能明显区分.结论:从序列特点和种内、种间变异性综合分析,rpl20-rps12序列更适宜黄精的基原鉴定.

关键词：黄精;叶绿体DNA;遗传距离;系统发育树;分子鉴定

所属期刊栏目：23

分类号：R282(中药学)

在线出版日期：2022-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：2072-2076