健脾化瘀解毒方调节NLRP3炎症小体活化的生物信息学研究

摘要：

目的 基于生物信息学方法分析健脾化瘀解毒方对核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(NLRP3)炎症小体活化的作用机制.方法 通过GEO数据库公开发表的基因芯片信息获取NLRP3炎症小体活化的相关基因,并进行差异基因表达分析.利用中药系统药理分析平台(TCMSP)筛选健脾化瘀解毒方的主要活性成分,并结合相关文献对其进行适当补充.借助Pubchem数据库和Swiss Target Prediction数据库查找主要活性成分的作用靶基因.绘制韦恩图得到活性成分靶点与差异基因的交集,即健脾化瘀解毒方调节NLRP3炎症小体活化的潜在作用靶点;构建健脾化瘀解毒方活性成分-靶点网络及靶蛋白相互作用(PPI)网络,并进行GO功能及KEGG通路富集分析.结果 共获得健脾化瘀解毒方9味中药的93个主要活性成分,798个作用靶点;得到NLRP3炎症小体活化相关靶点743个,交集靶基因62个;关键靶点包括IL-6、VEGFA、TNF、SRC、IL-1β、PTGS2、BCL2L1、CCND1、FGF2、ICAM1等;共涉及26条GO条目与25条相关信号通路.结论 健脾化瘀解毒方可能主要通过槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、豆甾醇等活性成分,作用于IL-6、IL-1β、TNF等核心治疗靶点,通过PI3K-Akt、HIF-1及MAPK等信号通路,调节NLRP3炎症小体活化来影响细胞焦亡,发挥防治胃癌前病变的作用.

关键词：健脾化瘀解毒方;胃癌前病变;NLRP3炎症小体;细胞焦亡;生物信息学

所属期刊栏目：32

分类号：R285.5;R857.3(中药学)

资助基金：国家自然科学基金项目;广东省自然科学基金项目;广东省重点领域研发计划项目;中国博士后科学基金会项目;广东省基础与应用基础研究基金联合基金项目;国家自然科学基金青年项目

在线出版日期：2021-11-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1321-1328