基于网络药理学联合分子对接探析香连丸治疗溃疡性结肠炎的分子机制

摘要：

目的 基于网络药理学和分子对接研究方法探析香连丸治疗溃疡性结肠炎的作用机制.方法 检索GEO DataSets数据库获取溃疡性结肠炎的疾病靶点,绘制差异基因火山图与热图.在TCMSP数据库中,分别收集黄连和木香的活性成分和靶点.将溃疡性结肠炎的差异基因与香连丸有效成分靶点取交集,并通过Cytoscape 3.8.0软件绘制香连丸治疗溃疡性结肠炎的“活性成分-靶点”网络,通过STRING 11.0平台构建蛋白互作网络,并根据度值大小筛选出核心靶点.同时将上述交集基因载入R软件中,进行GO功能和KEGG通路富集分析.使用Surflex-Dock GeomX进行分子对接验证.使用PyMOL 2.5和ligplot+2.1进行蛋白和配体之间的相互作用分析.结果 共筛选得到香连丸活性成分20个,包括槲皮素、豆甾醇、小檗浸碱、黄连素等,以及与GEO共有差异基因26个,涉及IL-6、CCL2、IL-1β、MMP9、PTGS2等关键基因.GO生物过程597条,细胞成分21个,分子功能50个,主要涉及脂多糖刺激变化(response to lipopolysaccharide)等生物过程,内质网腔(endoplasmic reticulum lumen)等细胞成分,细胞因子活性(cytokine activity)等分子功能.KEGG通路48条,主要涉及TNF信号通路、IL-17信号通路、Toll-样受体信号通路、NF-kappa B信号通路、Th17细胞分化等经典信号通路.分子对接结果表明香连丸的活性成分可以对核心靶点IL-6、CCL2、IL-1β、MMP9、PTGS2发挥调控作用.结论 香连丸治疗溃疡性结肠炎具有多成分、多途径、多靶点作用的特点,主要起到抗炎、抗氧化、调节肠道黏膜免疫系统、肠道平滑肌功能等多个作用,证明了中医整体观念的优越性.本研究为后续进一步研究香连丸治疗溃疡性结肠炎的基础和临床研究以及新药研发提供了思路和借鉴.

关键词：香连丸、溃疡性结肠炎、网络药理学、分子对接、GEO芯片

所属期刊栏目：32

分类号：R285.5(中药学)

资助基金：国家自然科学基金;广州中医药大学第一附属医院创新强院资助项目;广州中医药大学第一附属医院创新强院资助项目;一流学科建设项目;广东省研究生教育创新计划

在线出版日期：2021-04-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：365-373