基于转录组测序黑老虎角鲨烯合酶基因克隆和生物信息学分析

摘要：

目的 研究黑老虎[Kadsura coccinea(Lem.)A.C.Smith]转录组特征,克隆三萜生物合成上游途径的关键酶基因角鲨烯合酶(KcSQS),为黑老虎资源利用奠定基础.方法 对黑老虎不同部位进行转录组测序分析,根据筛选出的KcSQS候选基因序列设计引物,利用PCR技术进行基因克隆,并借助生物学软件进行生物信息学分析.结果 克隆得到一个KcSQS基因,包含全长1227 bp的开放阅读框(ORF),编码408个氨基酸,预测其蛋白分子量为46.65 kD,定位于细胞质膜,含一段跨膜超螺旋结构.该基因在黑老虎叶片中表达量最高,与同科植物厚朴(Magnolia officinalis Rehd.et Wils.)角鲨烯合酶(MoSQS)蛋白序列相似性为76.77％,预测为角鲨烯合酶.结论 该研究对黑老虎植物根、茎和叶进行转录组测序,成功克隆了角鲨烯合酶基因,并对其进行生物信息学分析,可为进一步研究黑老虎三萜类化合物的生物合成提供依据.

关键词：黑老虎、角鲨烯合酶、转录组测序、基因克隆

所属期刊栏目：30

分类号：R282.2(中药学)

资助基金：广州市科技计划;广州中医药大学高水平大学建设杏林青年学者项目

在线出版日期：2019-07-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：870-878