肝细胞癌相关差异基因及关键途径的生物信息学分析

摘要：

目的:利用生物信息学方法鉴定参与肝细胞癌(HCC)发生发展的候选基因及其潜在机制.方法:从基因表达数据库(GEO)中获得GSE19665、GSE41804和GSE84402,通过GEO2R工具和Venn图软件选择HCC组织与正常肝组织之间差异表达基因(DEG).对这些DEG进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路、基因本体(GO)富集分析、蛋白-蛋白相互作用(PPI)、生存分析(Kaplan-Meier)和基因表达谱交互式分析(GEPIA)验证.结果:3个数据集中共有139个一致表达的DEG,包括36个上调基因和103个下调基因.28个核心基因中有26个的预后明显较差,且有22个在HCC组织中高表达,4个基因(CCNB1、CDK1、BUB1和PT-TG1)显著富集于细胞周期途径.结论:HCC预后不良的4个显著上调的DEG可能是HCC患者的潜在治疗靶标.

关键词：肝细胞癌;生物信息分析;差异表达基因

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分类号：R737.5(肿瘤学)

资助基金：温岭市科技计划项目No.2020S0180102.No.2021S00210

在线出版日期：2021-12-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1022-1027