10.16035/j.issn.1001-7283.2023.04.012
小麦GzCIPK7-5B基因的生物信息学及表达分析
CIPK是植物钙感受器钙调磷酸酶B类似蛋白特定靶向的一类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,在钙离子信号转运中起到重要作用.为探究GzCIPK7-5B基因在小麦中的功能,利用RT-PCR方法从小麦品种贵紫麦1号中克隆得到GzCIPK7-5B基因,进行生物信息学分析.用RT-PCR检测GzCIPK7-5B基因在贵紫麦1号不同组织(根、茎、叶、籽粒)中的表达情况.运用qRT-PCR检测GzCIPK7-5B在籽粒3个时期(花后10、25、35d)的表达水平.结果表明,GzCIPK7-5B基因的开放阅读框为1296bp,编码431个氨基酸,蛋白含有丝氨酸—苏氮酸蛋白激酶家族保守结构域,具有CIPKs家族基因的特征.其编码的蛋白含有29个磷酸化位点,无跨膜结构,是一种无信号肽的不稳定亲水性核蛋白.GzCIPK7-5B基因与野生二粒小麦的TdCIPK7-5B序列相似度最高,蛋白序列同源性为100%,在根、茎、叶和籽粒中均有表达,在贵紫麦1号籽粒花青素合成3个重要时期(花后10、25、35d),花后25和35d的表达水平显著高于花后10d.
小麦、GzCIPK7-5B基因、RT-PCR克隆、生物信息学、基因表达
S662.1;Q786;S512.1
贵州省科技支撑计划;贵州省科技厅成果推广计划;贵州省科技计划;国家自然科学基金
2023-08-28(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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