基于叶绿体SSR分子标记的苦参种质资源遗传多样性分析

摘要：

以来自15个不同产地的150份苦参为材料,采用cpSSR分子标记技术探究不同产地苦参种质资源的遗传多样性.结果表明,18对cpSSR引物共扩增出311个条带,检测出97.47个等位基因,平均每对cpSSR引物扩增出17.28个条带.平均检测到的等位基因数(Na)为5.415,有效等位基因数(Ne)为4.395,Shannon's信息指数(Ⅰ)为1.535,多样性指数(h)为0.748,无偏多样性指数(uh)为0.832,多态信息含量(PIC)为0.886,PIC＞0.5说明18对cpSSR引物具有较高的多态性.不同产地的苦参遗传多样性丰富,其中山西武乡土河坪种质(THP)的Ⅰ为1.600,Ne为4.786,其他遗传多样性指数均较大,是遗传多样性较丰富的苦参产地.居群分子方差分析(AMOVA)表明,苦参种质内个体间差异大,苦参种质内遗传变异率大于种质间的.聚类分析、主坐标分析(PCoA)和STRUCTURE软件进行的遗传结构分析结果均将不同产地的苦参分为2个类群,并且分类结果有明显的地理相关性.第1类群中的9个苦参种质主要来自山西、河北、陕西和内蒙古等地,第2类群主要来自山东、河南、江苏以及安徽等地.18对cpSSR引物在苦参内具有很好的适用性.苦参种质资源的遗传多样性研究为发掘、利用与保护苦参种质资源以及优良品种的选育提供一定的理论基础.

关键词：苦参、叶绿体分子标记、遗传多样性、种质资源

分类号：S512.1;S635;S718.54

资助基金：山西省现代农业产业技术体系建设专项2021-11

在线出版日期：2023-03-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：30-37