谷子miR169家族及其靶基因的鉴定与功能分析

摘要：

microRNA广泛参与植物中多个生长发育过程,miR169家族是最保守的miRNA家族之一.对谷子miR169(sit-miR169)家族进行生物信息学分析,包括染色体分布、系统进化、碱基保守性、二级结构和sit-miR169及其靶基因的表达.鉴定了 15个sit-miR169,分布于7条染色体上.系统进化分析显示,sit-miR169家族前体sit-MIR169大致可以分为2簇,部分sit-MIR169成员与水稻osa-MIR169家族成员亲缘关系较近.sit-miR169的前体均可形成稳定的二级茎环结构,成熟体均产生于前体的5'端臂上,且成熟序列的碱基保守性很强.sit-miR169在花、叶和根中均有表达,具有明显组织表达特异性.sit-miR169的靶基因主要是NF-YA转录因子基因,此外还有L型凝集素类受体蛋白激酶、ω-6脂肪酸去饱和酶、转运蛋白Sec1a、SDG40蛋白、环指跨膜蛋白和核糖体大亚基假尿苷合酶SVR1基因等.miR169通过调控靶基因,尤其是NF-YA的表达量来影响植物的生长发育和对环境的应答.谷子NF-YA基因主要在根和穗中表达,表现出明显的组织表达特异性.此外,sit-miR169靶基因的表达受环境诱导,如干旱条件能进一步诱导Seita.9G521100基因在根中的表达.

关键词：谷子、miRNA、miR169、靶基因、生物信息学

分类号：S511.01;Q943.2;Q785

资助基金：国家重点研发计划;国家重点研发计划;国家自然科学基金;山西农业大学科技创新基金项目;山西省重点研发计划项目;山西省应用基础研究项目;山西农业大学科技创新基金项目

在线出版日期：2022-05-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：54-63