基于ITS2和psbA-trnH序列鉴别巴戟天及其3种近缘植物

摘要：

基于ITS2和psbA-trnH序列鉴别巴戟天及其3种近缘植物.对巴戟天及其3种近缘植物的ITS2和psbA-trnH序列进行PCR扩增和测序,运用遗传距离分析、DNA Barcoding Gap和系统发育(NJ)树3种方法对其进行鉴别.结果,巴戟天及其3种近缘植物的ITS2序列长度为237bp,GC含量为70.3％,保守率为86.08％,变异率为13.92％,ITS2序列上种间变异大于种内变异,存在较显著的DNA Barcoding Gap,其NJ树能准确鉴别出全部供试物种.巴戟天及其3种近缘植物的sbA-trnH序列长度为290bp,GC含量为20.2％,保守率为53.10％,变异率为46.55％,psbA-trnH序列上种间变异大于种内变异,无明显的DNA Barcoding Gap,其NJ树仅能准确鉴别出海滨木巴戟和羊角藤.ITS2序列的物种鉴定能力优于psbA-trnH序列.因此,基于ITS2和psbA-trnH序列能成功鉴别巴戟天及其3种近缘植物.

关键词：巴戟天、羊角藤、海南巴戟、海滨木巴戟、DNA条形码、分子鉴定、DNA Barcoding Gap、系统发育树

分类号：R28;S51

资助基金：春砂仁等“十大广药”DNA条形码标准化研究2013CXZDA011

在线出版日期：2017-11-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：55-60