高原作物青稞根及根际内生细菌群落结构的高通量分析

摘要：

利用高通量测序技术分析了西藏青稞主栽品种藏青2000根及根际内生细菌的16S V4变异区序列,同时应用UparseRON、KA等软件整理和统计样品序列数和操作分类单元(OTU)数,分析物种丰度及Alpaha 多样性等指标.获得的用于分析青稞根部内生细菌的有效序列和OTUs为55 192/3 613,用于分析青稞根际土壤内生细菌的有效序列和OTUs为62 181/4 399;根部及根际土壤Chao1指数分别为3 443.4290和4 632.5820,shannon多样性指数分别为8.542和9.967.在门水平对代表性OTU进行注释发现,青稞根及根际土壤内生细菌主要是变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes).在属水平上主要是假单胞菌属(Pseudomonas)、链霉菌属(Streptomyces)、土地杆菌属(Pedobacter)、黄杆菌属(Flavobacterium)、红游动菌属(Rhodoplanes).结果显示,青稞根及根际内生细菌具有丰富的多样性,且二者的优势菌属一致.

关键词：青稞、根、根际、内生细菌、种类、丰度

资助基金：西藏自治区自然科学基金2015212-14-23;西藏自治区青年教师创新计划项目QCZ2016-45;国家现代农业大麦青稞产业技术体系加工试验站CARS-05

在线出版日期：2017-01-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：49-52