大豆和拟南芥NFYB基因家族同义密码子使用偏好性的比较

摘要：

运用CodonW软件对大豆核因子NFYB(nuclear transcription factor Y B-subunit)基因家族CDS序列(coding sequence)的密码子组成、密码子使用性各参数和同义密码子相对使用度进行计算和统计分析,并与模式植物拟南芥NFYB基因进行比较.结果表明,NFYB基因家族CDS序列GC含量及同义密码子第3位的碱基含量直接影响着密码子使用偏好性程度的大小,并影响基因的表达水平.大豆GmNFYB基因与拟南芥AtNFYB基因对密码子的使用存在差异,AtNFYB基因家族偏好使用以A、U结尾的密码子,GmNFYB家族各基因偏好使用以G、C结尾的密码子.大豆不同GmNFYB基因在密码子使用上也存在差异,可能与基因表达水平、蛋白质结构和功能等因素有关.

关键词：大豆、拟南芥、NFYB基因、密码子偏好性

在线出版日期：2014-07-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

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