薄壳山核桃种质资源的SSR标记分析及数字指纹构建

摘要：

为了建立一套薄壳山核桃〔Carya illinoinensis(Wangenh.)K.Koch〕种质资源分子鉴别体系,本研究从薄壳山核桃SSR引物库中筛选出10对目的条带清晰、检测结果稳定的引物,对SSR标记进行染色体定位分析,基于66份薄壳山核桃样本叶片总DNA的扩增结果对每个SSR标记的遗传多样性和供试样本的UPGMA聚类结果进行分析,在此基础上筛选核心标记,利用种质信息编码和指纹码构建供试样本的数字指纹.结果表明:供试10个SSR标记位于薄壳山核桃的8条染色体上,其中,Chr05染色体上的标记最多,分别为Ciz023、Ciz064和PM-CIN4,其余染色体上各只有1个标记.供试SSR标记的观测等位基因数为3～9,有效等位基因数为2.0～6.2,Shannon's信息指数为0.923～2.009,观测杂合度为0.000～0.701,期望杂合度为0.492～0.839,多态信息含量为0.482～0.821.聚类结果表明:在遗传相似系数为0.262处,供试66份样本被分成2组,并在遗传相似系数为0.438处,进一步细分为6个亚组.根据10个SSR标记的多态信息含量筛选出4个核心标记,即PM-CIN4、Ciz25、Ciz033和Ciz023,可区分出62份样本.利用种质信息编码和指纹码成功构建了62份样本的数字指纹.综上所述,供试薄壳山核桃样本间的遗传相似性较大,构建的数字指纹能够快速、高效鉴别供试的绝大多数样本.

关键词：薄壳山核桃、SSR标记、遗传多样性、聚类分析、数字指纹

所属期刊栏目：32

分类号：Q946-33;S664.1(植物学)

资助基金：薄壳山核桃提质增效关键技术示范与推广2022TG04;江苏省种质资源圃建设项目

在线出版日期：2023-04-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：10-17