不同产地瓠瓜品种 ITS 序列的遗传多样性分析

摘要：

对国产29个瓠瓜也Lagenaria siceraria (Molina) Standl.页品种的 ITS 序列进行了扩增及测序,并结合引自GenBank 的国产9个瓠瓜品种以及国外6个瓠瓜品种和3个同属种类的 ITS 序列,对它们的 ITS 序列长度和 GC 含量以及变异位点进行比较,在此基础上构建系统发育树并对47个样本间的遗传关系进行研究。结果显示：供试47个样本的 ITS 序列均由 ITS1、5.8S rDNA 及 ITS2组成,各样本间的 ITS 序列长度、GC 含量以及变异位点差异明显。国产38个瓠瓜品种的 ITS 序列(包括 ITS1、5.8S rDNA 及 ITS2)长度为619~627 bp、GC 含量为58.00%~63.32%；国外9个样本的 ITS 序列长度为591~626 bp,GC 含量为54.17%~63.26%。序列比对结果显示：国产38个瓠瓜品种的 ITS 序列同源率为84.6%~100.0%,包含221个变异位点；其中,来源于山东的品种‘砧木2’(‘Zhenmu No.2’)的 ITS 序列包含的变异位点最多,与其他品种间的同源率也最低。在系统发育树上,国产38个瓠瓜品种可分为3个分支,来源于山东的品种‘砧木2’和来源于河南的品种‘西瓜砧木1’(‘Xiguazhenmu No.1’)各自聚为第1和第2分支；其余36个品种聚为第3分支。而供试的47个样本则可分为2个分支和5个亚组,第1分支可分为2个亚组,包括国产品种‘砧木2’和产自日本的2个品种；第2分支包含的44个样本则进一步分为3个亚组,国产品种‘西瓜砧木1’和产自法国的品种‘白花瓠瓜’(‘White-flowered gourd’)各自聚为第1和第2亚组,其余的42个样本聚为第3亚组。研究结果表明：供试的不同产地瓠瓜品种间存在丰富的遗传变异和地理分化现象,其 ITS 序列差异与地理分布有一定关系。

关键词：瓠瓜、ITS 序列、变异位点、同源性、遗传分化、系统发育

分类号：Q946-33;S642.9(植物学)

资助基金：广东省自然科学基金博士科研启动基金资助项目10451064001006063;广东省农业科学院院长基金资助项目201007

在线出版日期：2014-10-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：24-35