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水稻DUF761基因家族成员鉴定与表达谱分析
DUF761家族是植物中一个未知功能结构域蛋白家族(DUF,domains of unknown function),其在水稻中的功能从未被探索.本研究通过生物信息学分析在水稻全基因组共鉴定到33个水稻DUF761基因家族成员.系统发育分析将这些成员分为3个亚家族.保守基序Motif-1分布于所有家族成员.在OsDUF761基因启动子区域共发现15种与胁迫响应、激素响应和发育相关的顺式作用元件.有30个基因的启动子区域含有ABRE元件(脱落酸响应),其中OsDUF761-21的启动子含有16个ABRE元件.组织表达谱检测结果表明,不同的OsDUF761基因成员在水稻中具有相似或者迥异的组织表达谱.在ABA、JA、低温、干旱和稻瘟菌分别处理水稻后,水稻中分别有12、13、24、24和18个OsDUF761基因的转录表达水平发生显著变化;其中,有8个基因在ABA处理和干旱处理后表现出共同的显著上调或者下调响应趋势;有6个基因在JA处理和稻瘟菌处理后表现出共同的响应趋势.本研究对水稻DUF761 基因家族进行了全面分析,有助于进一步明确DUF761家族成员的生物学功能.
水稻、DUF761基因家族、进化分析、胁迫、表达谱分析
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S881.2;Q966;R734.2
国家自然科学基金;湖南省自然科学基金;湖南创新型省份建设专项;岳麓山种业创新项目;长沙市自然科学基金
2022-10-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共13页
1487-1499