广东水稻核心种质耐冷萌发全基因组关联分析

摘要：

萌发期耐冷性的强弱直接影响水稻直播时的成苗率.为高效地培育萌发期耐冷性强的水稻品种,本研究通过统计309份广东省水稻核心种质资源的低温萌发比率,筛选到57份萌发期耐冷性强的水稻品种.同时,以低温萌发比率为表型数据和高密度的SNP标记为基因型数据,利用全基因组关联分析鉴定到11个水稻低温萌发QTLs.其中qLTG2-1、qLTG7-1、qLTG7-2和qLTG10-1与前人定位的水稻低温萌发QTL共定位.qLTG11-1是本研究新鉴定的最显著的水稻低温萌发QTL.利用RNA-seq和qRT-PCR对其进行候选基因预测和验证,发现在低温萌发期间,qLTG11-1 区间内的LOC_Os11g07020在低温萌发比率高和低的品种中有不同的表达模式.LOC_Os11g07020编码果糖-1,6-二磷酸醛羧酶同工酶,可能通过调控糖酵解反应而影响水稻萌发期耐冷性.本研究筛选到多份耐冷性强的水稻品种,并找到可能调控水稻萌发期耐冷性的候选基因,可为培育萌发期耐冷性强的水稻品种提供参考.

关键词：水稻、低温萌发、果糖-1、6-二磷酸醛羧酶、全基因组关联分析

所属期刊栏目：23

分类号：S511;S6;F326.11

资助基金：广东省农作物种质资源专项;广东省广州市国家野生稻种质资源圃项目;科技创新战略专项;广东省重点实验室运行费;广东省重点领域研发计划项目

在线出版日期：2022-10-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：1425-1437