萝卜全基因组中SPL基因家族成员的鉴定与分析

摘要：

SQUAMOSA启动子结合类蛋白(SPL)基因家族,作为一类在植物中广泛存在的转录因子,在植物生长发育、信号转导及生理生化过程等方面具有重要作用.本研究通过生物信息学方法,从萝 卜基因组中鉴定出分布于8条染色体上的26个SPL基因,并将其按照所处染色体位置命名为RsSPL1～RsSPL26.其氨基酸数目在139～1021aa,蛋白分子量在16167.7～112219.48 Da,等电点分布在5.77～9.67,外显子数量从2到11个不等.microRNA结合位点预测发现12个RsSPL含有miR156的结合位点,11个RsSSPL含有miR157的结合位点.对它们在不同组织和发育时期的表达模式研究发现,该基因家族成员具有一定的时空表达差异性,且同一个亚家族的成员具有相似的表达模式.本研究为萝卜 SPL基因家族的功能研究奠定了基础.

关键词：萝卜、SPL基因家族、基因组分布、生物学特点、基因表达

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资助基金："十三五"国家重点研发计划;国家自然科学基金;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;中国农业科学院创新工程项目CAAS-ASTIP-IVFCAAS

在线出版日期：2021-08-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：1145-1156