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大豆UBC基因家族鉴定及GmUBC46基因的功能初步分析
泛素/26S蛋白酶体途径在植物响应非生物胁迫反应中起着重要的作用.E2(泛素结合酶,UBC)是蛋白质泛素化中重要的泛素结合酶,与E1和E3共同参与蛋白降解途径.本研究通过构建隐马尔可夫模型,鉴定了54个大豆UBC基因,通过进化树分析将该家族成员分为11个亚家族(A-K).蛋白保守结构域分析表明,GmUBC家族蛋白成员大部分含有保守Motifl、Motif2与Motif 3,且均属于泛素结合酶保守结构域.组织定位分析表明大部分GmUBC家族基因成员在大豆根、茎、叶、花等组织中有所表达.转录组数据表明有20个GmUBC基因在干旱、盐或冷胁迫下具有不同的表达模式,启动子顺式作用元件分析发现其胁迫响应过程可能与激素信号转导相关.进一步通过qRT-PCR发现GmUBC46基因能积极响应干旱、盐或冷胁迫诱导上调表达.通过酵母功能验证表明,GmUBC46基因降低了对干旱或盐胁迫的耐受性.综上,本研究初步阐明了大豆UBC基因家族的基本特性及GmUBC46基因的耐逆功能,为后续研究提供了重要依据和参考价值.
UBC家族、大豆、GmUBC46、干旱、盐
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黑龙江省自然科学基金面上项目;黑龙江省教育厅面上项目
2020-05-07(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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