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裂叶榆叶绿体基因组及CP-SSR位点分析
榆树材质优良,具有良好的耐旱、耐寒和耐盐碱能力,从温带、暖温带到亚热带都有分布.本研究对榆科植物(裂叶榆)的叶绿体基因组进行De novo测序,裂叶榆叶绿体基因组序列全长为158953 bp,为典型的四段式结构,其中LSC区长度为88032 bp,SSC区长18846 bp,两个IR区长26037 bp,GC含量为35.57%.裂叶榆叶绿体基因组总共编码139个基因,包括85个蛋白编码基因、8个rRNA和46个tRNA基因.裂叶榆的叶绿体基因组存在755个SSR位点,SSR序列长度主要以6~8 bp的短序列为主,SSR共有49个重复单元,以A/T和AT/AT为主,占所有SSR位点的66.09%.选取42个物种叶绿体基因组的共有蛋白编码基因进行系统进化分析表明,裂叶榆与大麻科、桑科物种亲缘关系最近,榆科与大麻科、桑科均属于荨麻目,与传统分类学相吻合.本研究报道了裂叶榆的叶绿体基因组序列,对今后榆树的光合作用研究、CP-SSR引物开发、进化研究及叶绿体转基因工程等研究具有重要意义.
裂叶榆、叶绿体基因组、CP-SSR
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国家自然科学基金31370664;河北农业大学科研发展基金1699025
2018-12-14(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共10页
1187-1196