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基于全基因组芯片开发水稻HRM特异分子标记
植物中广泛分布着单核苷酸多态性(SNP)位点.在此基础上发展而来的SNP标记因其具有高分辨率和共显性等优点,已成为当前作物遗传研究重要的分子工具.本研究拟建立基于高分辨率熔解曲线(HRM)技术的SNP分子标记,从而实现对栽培稻和野生稻的高效基因分型,为今后水稻的基因挖掘、品种鉴定以及分子育种等提供可靠、快捷的技术工具.利用水稻全基因组9 K SNP芯片对栽培稻品种黄华占和野生稻Y605进行扫描,寻找两者之间的SNP位点,并将其开发成基于HRM技术的特异分子标记.然后,利用这些分子标记对亲本黄华占、野生稻Y605以及两者的BC3回交群体进行分子检测,以验证其有效性.水稻9K基因芯片在黄华占与野生稻Y605之间总共找到了4198个SNP位点,它们在12条染色体上较均匀分布.在水稻第1号染色体上随机挑选出5个SNP位点开发成基于HRM技术的特异分子标记.利用这些标记对黄华占与野生稻Y605的BC3F1和BC3F2群体进行检测分析,发现它们都能准确区分亲本的纯合与杂合基因型.并且,在回交后代的第1号染色体ZY1-1～ZY1-4标记区间检测到野生稻片段插入.水稻全基因组9 K SNP芯片可以很好地应用于水稻SNP标记的开发.开发的SNP特异标记能准确、高效地对栽培稻和野生稻进行基因分型.进一步完成基于HRM技术的水稻全基因组SNP标记的开发,可为今后野生稻的分子遗传研究、有利基因挖掘和育种应用提供高效的分子检测手段.
HRM技术、水稻基因组SNP芯片、分子标记、野生稻、有利基因挖掘
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国家科技资源共享服务平台项目NICGR2017-39;广西壮族自治区主席科技资金项目1517-03;广西农业科学院基本科研业务专项项目2015YT14
2018-12-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
1055-1063
