普通烟草MATE基因家族分析及功能预测

摘要：

植物多药和有毒化合物排出家族(MATE,multidrug and toxic compound extrusion)是一类可转运毒素、金属离子、次级代谢产物的次级转运蛋白家族.该家族主要在植物的解毒机制中发挥作用,部分成员也参与植物的形态建成过程.MATE家族在烟草基因组中的数量、特征及功能目前尚未开展系统分析.本研究利用生物信息学方法对普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组中的MATE基因进行了预测分析,共预测到131个基因,分为4个亚家族.亚家族3在进化树中形成较为独立的分枝,其跨膜区数量、亚细胞定位、保守结构域方面与其他亚家族不同.转录组数据显示,相当一部分MATE家族基因在所有组织中低量表达.GO功能注释结果表明该家族成员主要作为一种转运体,在应激响应、生物调控等过程中发挥作用.本研究为烟草及其他植物中MATE家族的鉴定和功能研究提供了数据基础.

关键词：普通烟草、MATE家族、生物信息学分析

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资助基金：国家烟草专卖局烟草基因组计划重大专项项目110201301005JY-05

在线出版日期：2015-12-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1307-1314