黄瓜抗黑星病相关基因的差异表达分析
以抗黑星病黄瓜材料HX1为试材,接种黑星病菌(Cladosporium cucumerinum)2h、8h、20 h、32 h和72 h的叶片作为试验方(Tester),相应的未接种叶片作为对照方(Driver),利用SSH技术,构建了黑星病菌侵染初期的正向和反向cDNA-SSH文库.用巢式引物PCR检测插入片段,获得了200个阳性克隆,通过测序,除去重复序列,共得到105个Unique ESTs,其中50个为singleton,55个为contings.与非冗余蛋白数据库进行BLASTx比对,结果显示,17条ESTs未找到同源序列,88条非重复序列和已知基因的同源性较高,占全部ESTs序列的83.8%,其中86条ESTs与非冗余蛋白数据库已知功能的蛋白具有高度的相似性.结合高密度点阵膜杂交差异筛选,阳性率为75.0%.经初步分析这些序列的功能,差异表达的ESTs功能涉及能量和基础代谢、信号转导、蛋白和核酸代谢、光合作用及逆境中特异表达的基因等方面,为研究黄瓜抗黑星病基因提供了依据.
黄瓜、黑星病、抑制性消减杂交、差异表达
14
国家科技支撑计划项目2013BAD01B04;农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室资助
2013-07-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共7页
501-506,517